Ristisubventiosta on enemmän haittaa kuin hyötyä, koska se on nostanut lippujen hintoja niillä reiteillä, missä joukkoliikenteellä olisi oikeasti potentiaalia kuljettaa joukkoja. Kun suuren kysynnän väleillä halvat hinnat siirtävät ison joukon matkustajia henkilöautoista joukkoliikenteeseen, voidaan uhratakin joitakin pienemmän kysynnän välejä, joilla auton käyttöön pakotetaan pieni joukko matkustajia.
Ristisubventio on myös ollut liikennöitsijöille täysin vapaaehtoista. Kannattavia reittejä hallussaan pitäneet liikennöitsijät ovat voineet aivan hyvin lakkauttaa hiljaiset reitit ja saada silloin suuremman voiton ajamalla vain kannattavia reittejä.